Es un organismo público que se crea como órgano desconcentrado de la Consejería de Medio Rural y Pesca, autoridad competente en materia de producción agraria. El COPAE se crea en el año 1996 mediante el Decreto 67/1996, por el que se designa la Consejería de Medio Rural y Pesca como autoridad competente en materia agraria y el COPAE como autoridad de control. Actualmente se regula mediante el Decreto 81/2004, de 21 de octubre, como órgano desconcentrado de la Consejería de Medio Ambiente y Desarrollo Rural.
Su funcionamiento se regula mediante un reglamento de régimen interno, aprobado por el Pleno del Consejo. La principal función del COPAE es llevar el control y la certificación de la producción ecológica, por lo que es el responsable de gestionar los registros de operadores, es decir, de productores, elaboradores, comercializadores e importadores de productos ecológicos. Al tratarse de un sistema de certificación pública, los operadores se benefician de no tener que asumir todos los costes que conllevan el control y certificación. Tiene además otra serie de funciones, una de las principales es la promover el consumo de los alimentos ecológicos, así como realizar la difusión y el conocimiento de los sistemas de producción ecológica.
Para más información: COPAE